MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120zeta

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003241	CATAG	2	10	73	82	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_003241	TAC	2	6	125	130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003241	TTAA	2	8	172	179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003241	ATG	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003241	TCT	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_003241	ATC	2	6	270	275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_003241	GAC	2	6	316	321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003241	ATG	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003241	TCAA	2	8	359	366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003241	AC	3	6	490	495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003241	AGA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003241	CGC	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_003241	CTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_003241	AGA	3	9	687	695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003241	GCT	2	6	718	723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003241	TATG	2	8	817	824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003241	AAC	2	6	902	907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003241	GTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003241	AAG	2	6	949	954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003241	CAGGG	2	10	1004	1013	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003241	A	8	8	1081	1088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003241	AG	3	6	1101	1106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003241	TCG	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_003241	TGA	3	9	1137	1145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003241	AAAG	2	8	1147	1154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003241	ATG	2	6	1244	1249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003241	GGCA	2	8	1311	1318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003241	GCAA	2	8	1376	1383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003241	CAGC	3	12	1387	1398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_003241	A	7	7	1556	1562	100 %	0 %	0 %	0 %	17158062
31	NC_003241	GTAG	2	8	1677	1684	25 %	25 %	50 %	0 %	17158062
32	NC_003241	G	6	6	1688	1693	0 %	0 %	100 %	0 %	17158062
33	NC_003241	CTG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158063
34	NC_003241	TCAA	2	8	1731	1738	50 %	25 %	0 %	25 %	17158063
35	NC_003241	T	6	6	1784	1789	0 %	100 %	0 %	0 %	17158063
36	NC_003241	GTA	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003241	TA	3	6	1935	1940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003241	TAC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003241	CAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_003241	ATC	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003241	TTTA	2	8	2305	2312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003241	AC	4	8	2348	2355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003241	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158064
44	NC_003241	GCG	2	6	2449	2454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158064
45	NC_003241	ATC	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158064
46	NC_003241	AGAA	2	8	2529	2536	75 %	0 %	25 %	0 %	17158064
47	NC_003241	ATC	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158064
48	NC_003241	ATAG	2	8	2558	2565	50 %	25 %	25 %	0 %	17158064
49	NC_003241	A	6	6	2770	2775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003241	CAT	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_003241	T	7	7	2891	2897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003241	ATG	2	6	2915	2920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003241	GAT	2	6	2960	2965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
54	NC_003241	GCA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17158065
55	NC_003241	TGGG	2	8	3064	3071	0 %	25 %	75 %	0 %	17158065
56	NC_003241	GGCT	2	8	3081	3088	0 %	25 %	50 %	25 %	17158065
57	NC_003241	TGC	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158065
58	NC_003241	A	6	6	3156	3161	100 %	0 %	0 %	0 %	17158065
59	NC_003241	ATG	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
60	NC_003241	AC	3	6	3228	3233	50 %	0 %	0 %	50 %	17158065
61	NC_003241	TAA	2	6	3327	3332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17158065
62	NC_003241	TGC	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158065
63	NC_003241	TCA	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158065
64	NC_003241	ATG	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
65	NC_003241	GAT	2	6	3428	3433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
66	NC_003241	AGT	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
67	NC_003241	TGA	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
68	NC_003241	CAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158065
69	NC_003241	GAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17158065
70	NC_003241	AGG	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
71	NC_003241	ACA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17158065
72	NC_003241	A	6	6	3791	3796	100 %	0 %	0 %	0 %	17158065
73	NC_003241	ATG	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
74	NC_003241	ATAG	2	8	3881	3888	50 %	25 %	25 %	0 %	17158065
75	NC_003241	AC	3	6	3901	3906	50 %	0 %	0 %	50 %	17158065
76	NC_003241	CG	3	6	3923	3928	0 %	0 %	50 %	50 %	17158065
77	NC_003241	CCG	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17158065
78	NC_003241	ACC	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17158065
79	NC_003241	AGG	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
80	NC_003241	AGG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
81	NC_003241	CGG	2	6	4069	4074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158065
82	NC_003241	GAT	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
83	NC_003241	AAG	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17158066
84	NC_003241	GT	3	6	4305	4310	0 %	50 %	50 %	0 %	17158066
85	NC_003241	AT	3	6	4418	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	17158066
86	NC_003241	ATGAT	2	10	4432	4441	40 %	40 %	20 %	0 %	17158066
87	NC_003241	AATT	2	8	4570	4577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003241	TAA	2	6	4669	4674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003241	A	7	7	4707	4713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003241	GAT	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003241	CGCGA	2	10	4979	4988	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_003241	AAAG	2	8	5087	5094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003241	CGG	2	6	5095	5100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_003241	ATC	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_003241	AAAG	2	8	5203	5210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003241	TG	3	6	5254	5259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003241	GAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003241	CAA	2	6	5299	5304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_003241	GAAT	2	8	5461	5468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003241	AGAAT	2	10	5477	5486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.